化學實驗室的通風方式有兩種，即局部排風和全室通風。
局部排風是在有害物質產生后立即就近排出，這種方式能以較少的風量排走大量的有害物質，能量省而效果好，是改善現有實驗室條件可行和經濟的方法，也可能是適應新實驗室通風建設的最好方式。實驗室凈化工程國家實驗室代表國家最高水平，是按國際一流標準建立的，規模非常大，基本包括本學科領域所有研究方向，而且人員配備上要求面向國內外招聘最優秀的研究人員，直接參與國際競爭，往往是多學科交叉的創新平臺。對于有些實驗不能采用局部排風，或局部排風滿足不了排風要求時，采用全室通風。
通風柜是實驗室中最常用的一種局部（part)排風設備，他的性能好壞主要取決于通過通風柜空氣移動的速度。影響正面速度和空氣運動的因素是渦流、柜的入口形狀、熱載量、機械作用、排風孔設計和阻凝物等。此外，尚于他的防火能力、耐腐蝕性、是否便于清洗以及污染物進入排風系統前收集某些污染物的能力等性能有關。一般認為，實驗室中的通風柜應能適應易燃的液體和氣體，而且結構材料應具有幾分鐘的耐火能力，以保持通風柜的完整和及時將火封熄。
通風柜的排風系統可分為集中式和分散式兩種。實驗室設備實驗脊椎動物生物安全防護實驗室，其適用微生物范圍與同級的一般生物安全防護實驗室相同。
※【集中式】是把一層樓面或幾層樓面的的通風柜組成一個系統，或者整個實驗樓分成一二個系統。實驗室凈化工程結構和設施、安全操作規程、安全設備適用于對健康成年人已知無致病作用的微生物，如用于教學的普通微生物實驗室等。它的特性是通風機少，設備投資省，而且對通風柜的數量稍有增減，以及位置的變更，都具有一定的適應性。然而由于系統較大，風量不易平衡，盡管每個通風柜上都裝有調節閥，但使用不方便，并且也不容易達到預定的效果。如果系統風管損壞需要檢修時，那么整個系統的通風柜就無法使用。所以，原來采用集中式系統的實驗室，先后都改為用分散式系統。
※【分散式】是把一個通風柜或同房間的幾個通風柜組成一個排風系統。他的特點是：可根據通風柜的工作需要來啟閉通風機，相互不受干擾，容易達到預定的效果，而且比集中式節省能源，因為集中式系統，只要一個通風柜在使用，就得開動大通風機。分散式由于系統小，排風量也小，阻力也小，所以通風機的風量、風壓都不大，躁聲與振動相應也較小。分散式還有一個特點，是對排出不同性質的有害氣體易于處理。缺點是通風機的數量多、系統多，如果通風機集中于通風機房內，那么投資就會增大，如果通風機分散布置，而且就地安裝，雖然通風機的投資增加，但風管的投資可節省，最后總投資不一定增大，建議使用分散式。
在劃分系統(system)時，同一個房間內如有兩個以上的通風柜，應劃為一個系統，避免一個通風柜在使用，其他的通風柜產生倒流，使室內受到污染。同樣，一個房間內除了一個排風系統外，不宜再裝置其他排風設備。
排風系統的通風機，一般都裝在屋頂上，或頂層的通風機房內，這樣可不占用使用面積，而且使室內的排風管道處于負壓狀態，以免有害物質由于管道的腐化侵蝕 或損壞，以及由于管道不嚴密而滲入室內，此外，通風機安裝在屋頂上或頂層的通風機房內，檢修方便，易于消聲或減振。
排風系統有害物質排放高度應按現行的《工業企業設計衛生標準》和《工業三廢排放標準》執行。在一般情況下，如果附近五十米以內沒有較高建筑物時，排放高度應超過建筑物最高處兩米以上。
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