實驗室廢水的成分比較復雜，它受多種因素影響，如試驗過程所用的原料、化學藥劑、用水水質、水量、放射性同位素種類及使用后的化學組成等。一般廢水可分為三類：含有機物質的廢水、含無機物質的廢水、含有機物質和無機物質的廢水。

1.廢水。一般有物理法、化學法、生物法等。物理法主要利用物理作用以分離廢水中的懸浮物。化學法主要利用化學反應的作用來處理廢水中的溶解物或膠體物質。生物法是利用微生物的作用去除廢水中的交替和溶解的有機物質。
2.酸堿廢水處理實驗室排出一些酸性或堿性廢水，由于實驗室的性質和類型不同，所排出的酸性廢水種類、濃度等都不相同。因此，酸性廢水在需要處理時應和其他非酸性廢水分流排出。酸性或堿性廢水在可能和合理的情況下要盡量回收利用。
活毒廢水處理設備宜設在最低處，便于污水收集和檢修。
三級和四級生物安全實驗室防護區活毒廢水的處理裝置應采用高溫滅菌方式。應在適當位置預留采樣口和采樣操作空間。

四級生物安全實驗室雙扉高壓滅菌器的排水應接人防護區廢水排放系統。

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