PCR實(shí)驗（experiment)室依據(jù)所使用的方法可分為試劑準(zhǔn)備、標(biāo)本制備、擴(kuò)增、產(chǎn)物分析(Analyse)等三或四個區(qū)域。潔凈實(shí)驗室主要用于微生物學(xué)、生物醫(yī)學(xué)、生物化學(xué)、動物實(shí)驗、基因重組以及生物制品等研究使用的實(shí)驗室統(tǒng)稱潔凈實(shí)驗室-生物安全實(shí)驗室。無菌試驗室、生物安全實(shí)驗室由主實(shí)功能驗室與其他實(shí)驗室及輔助功能用房組成。只是使用實(shí)時熒光PCR儀、HIV病毒載量測定儀的PCR實(shí)驗室，有上述前面三個區(qū)域即可。各區(qū)域應(yīng)完全獨(dú)立分隔，不應(yīng)有任何的空氣直通。
PCR實(shí)驗（experiment)室對污染的預(yù)防與控制（control)：
PCR實(shí)驗（experiment)室設(shè)計的核心(core)問題是如何避免污染。凈化實(shí)驗室必須控制實(shí)驗室的潔凈度，對新風(fēng)進(jìn)行過濾，使實(shí)驗室達(dá)到一定的凈化要求。其中排風(fēng)系統(tǒng)是重點(diǎn)，對于保證實(shí)驗室相對負(fù)壓環(huán)境和有效過濾室內(nèi)污染排風(fēng)起著重要的作用。凈化實(shí)驗室控制系統(tǒng)是整個潔凈實(shí)驗室安全運(yùn)行的神經(jīng)中樞,由于潔凈實(shí)驗室-生物安全實(shí)驗室的實(shí)驗對象是危險性的微生物，出于嚴(yán)格控制污染的原則，它要求以最少的維護(hù)人員，運(yùn)用最優(yōu)化的管理維護(hù)手段，來實(shí)時監(jiān)控每一個實(shí)驗室中設(shè)備所處的物理環(huán)境，保證實(shí)驗室運(yùn)行過程中始終處于相對負(fù)壓環(huán)境，防止危險性微生物外泄。在實(shí)際工作中，常見的有以下幾種污染類型：擴(kuò)增產(chǎn)物的污染；天然基因組DNA的污染；試劑的污染以及標(biāo)本間的污染。由于一旦發(fā)生污染，實(shí)驗就必須停止，直到找到污染源為止，而且實(shí)驗結(jié)果必須作廢，需重新進(jìn)行實(shí)驗。所以發(fā)生污染后再圍繞(circumfuse)實(shí)驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣(fán suǒ)，浪費(fèi)人力物力。因此要避免污染，首先應(yīng)是預(yù)防，而不是排除（Remove)。
PCR實(shí)驗（experiment)室功能區(qū)分為：
一、普通實(shí)驗（experiment)區(qū)——法醫(yī)物證常規(guī)檢驗室、法醫(yī)物證存儲室、受案室、檢材室、骨骼(skeleton)提取實(shí)驗（experiment)室、數(shù)據(jù)（data)比對分析(Analyse)室、緊急淋浴洗眼間、潔具間、洗衣間、測序儀專用UPHOTOSHOP機(jī)房；
二、特殊實(shí)驗（experiment)區(qū) / 污染控制（control)區(qū)——更鞋 / 緩沖走廊、更衣 / 緩沖間、現(xiàn)場物證DNA提取間（30-50㎡）、嫌犯血樣DNA提取間(15-30㎡）、試劑混配間(15-30㎡）、PCR擴(kuò)增間(15-30㎡）、擴(kuò)增產(chǎn)物測序間(15-30㎡）；
