標準的PCR實驗室 試劑準備區: 

 儀器設備主要應有加樣器、冰箱、天平、低速離心機、混勻器、可移動紫外燈等。可使用超凈工作臺作為試劑配制操作臺面。 
標準的PCR實驗室 標本制備區 
 儀器設備主要應有生物安全柜（最好為B2, 可避免提取核酸在柜內反復循環，造成標本間交叉“污染”，出現假陽性結果。此外還應配備加樣器、臺式高速離心機（冷凍及常溫）、臺式低速離心機、恒溫設備（水浴和/或干浴儀）、冰箱、混勻器和可移動紫外燈等。 
標準的PCR實驗室 擴增區 
主要儀器就是核酸擴增熱循環儀（PCR儀，實時熒光或普通的）。熱循環儀的電源應專用，并配備一個穩壓電源或UPS，以防止由于電壓的波動對擴增測定的影響。此外，根據工作需要，還可配備加樣器、超凈臺等。 
標準的PCR實驗室 產物分析區： 
本區所使用的儀器設備可能有加樣器、電泳儀（槽）、電轉印儀、雜交爐或雜交箱、水浴箱、DNA測序儀、酶標儀和洗板機等。 
在理想情況下，PCR實驗室試劑準備、標本制備、擴增三個區域可設置緩沖間。在緩沖間內，可設置正壓，使室內空氣不流向室外，室外空氣不流向室內。

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